IRD - Ingenieur d'études activités AMR (secteur animal) H/F

Poste d’ingénieur d’Études en charge des activités AMR pour le volet animal dans l’océan Indien.CDD dans le cadre du Projet Interreg VI RESIST-OI (AntibioRÉSISTance dans le Sud-Ouest de l'Océan Indien : Approche One Health pour l'étude de l'émergence, la dynamique de diffusion et des alternatives thérapeutiques)La personne recrutée sera basée dans l’équipe ASTRE du CIRAD au Cyroi, La Réunion au sein de laquelle elle interviendra sur les activités AMR du volet animal prévues dans le cadre du projet RESIST-OI. Sous la responsabilité hiérarchique du Dr David Wilkinson, chercheur responsable de la thématique AMR au sein de l’équipe ASTRE du CIRAD basée au Cyroi et responsable du volet animal du projet RESIST-OI. Elle/il sera également suspectible d’intervenir ponctuellement dans les locaux du CHU de La Réunion pour des équipements spécifiques (spectrométrie de masse, …). Elle interagira de manière quotidienne avec l’équipe ASTRE du CIRAD. Elle interagira également avec les coordonnateurs du projet RESIST-OI (Pr Guillaume Miltgen et Dr Patrick Mavingui).Les fonctions principales de l‘ingénieur(e) seront de réaliser et traiter les échantillonnages prévus sur les animaux domestiques et d’élevage dans les différents territoires et pays du sud-ouest de l’océan Indien (notamment La Réunion et Madagascar) et visant à caractériser les communautés bactériennes résistantes et les déterminants génétiques impliqués. Elle/Il appuiera les partenaires dans la réalisation des analyses microbiologiques et l’envoi des souches résistantes pour le séquençage au CIRAD. Elle/Il assurera l’animation scientifique et partenariale. La personne recrutée sera impliquée dans l’analyse des données et leur valorisation. Elle sera amenée à travailler avec les autres membres des équipes ASTRE et CHU/PIMIT impliqués dans le projet ainsi qu’avec l’ensemble des partenaires, aussi bien à La Réunion que dans la région. Il s’agira aussi d’appuyer les partenaires dans la mise en place d’une surveillance de l’AMR dans les élevages et de renforcer les capacités locales de diagnostic, de typage et de génomique des bactéries résistantes, à travers des formations et des transferts. Elle devra aussi contribuer à renforcer la sensibilisation et les bonnes pratiques d’usage des antibiotiques en élevage grâce à une stratégie de communication adaptée.Ce poste s’insère dans les activités du projet Interreg VI RESIST-OI coordonné par Dr. Patrick Mavingui (UMR PIMIT) et Prof. Guillaume Miltgen (CHU/UMR PIMIT). Il sera affecté dans l’équipe ASTRE du CIRAD basée au CYROI à Saint Denis La Réunion, partenaire de l’UMR PIMIT et responsable du volet animal (filières d’élevage, animaux domestiques) du projet, sous la responsabilité du Dr David Wilkinson, chercheur microbiologiste et bio-informaticien, et du Dr Thierry Baldet responsable de l’équipe ASTRE Océan Indien.