GUSTAVE ROUSSY - Bio Informaticien H/F

L'espoir de guérir le cancer a un nom, Gustave Roussy. Premier centre européen de lutte contre le cancer et de renommée internationale, Gustave Roussy recrute un Bio Informaticien H/F en CDI de chantier de 2 ans. Le Laboratoire de génétique et de biologie des cancers de la thyroïde, dirigé par Iñigo Landa, PhD, au sein de l’INSERM UMR981 et de l’IHU-PRISM, explore les aspects fondamentaux et translationnels des cancers de la thyroïde, avec un accent particulier sur les formes avancées de la maladie. Le laboratoire utilise diverses techniques s’appuyant sur des échantillons humains, des systèmes cellulaires et des modèles animaux. Notre objectif est de produire des connaissances scientifiques de haute qualité tout en favorisant un bon équilibre entre vie professionnelle et vie personnelle. Le poste proposé est initialement financé pour une durée de deux ans. Le ou la candidat(e) retenu(e) devra travailler sur des projets collaboratifs entre Iñigo Landa et Julien Hadoux du Comité des Tumeurs Endocrines.La personne recrutée réalisera des analyses bioinformatiques sur des données existantes et à venir. Celles-ci incluent des données de séquençage en vrac (WES, WGS, RNAseq, long read DNAseq), des données de RNA-seq en cellule unique/noyau unique et multiome (RNA/ATACseq), ainsi que des données de transcriptomique/protéomique spatiale, obtenues à la fois à partir d’échantillons de patients et de modèles animaux de la maladie.Les projets actuels du laboratoire visent à comprendre comment les altérations génétiques et épigénétiques favorisent la progression des cancers de la thyroïde, ainsi qu’à décrypter leur microenvironnement tumoral immunitaire. Le/la candidat(e) sera amené(e) à travailler en tant que Bio Informaticien(ne) sur les tâches suivantes :·       Analyser des données de séquençage nucléaire unicellulaire (snRNA-seq) et de multiome déjà générées à partir de modèles murins génétiquement modifiés de cancers de la thyroïde ;·       Contribuer à l’intégration et à l’analyse de données issues de profils multi-omiques existants et futurs (bulk et cellule unique) provenant de cohortes de patients atteints de cancer thyroïdien anaplasique ;·       Analyser des données de RNA-seq en vrac (bulk RNA-seq), d’ATAC-seq et de séquençage à longues lectures obtenues à partir d’échantillons de patients et d’organoïdes dérivés de patients.Participer activement aux réunions de l’équipe, échanger avec les membres du laboratoire expérimental afin d’identifier leurs besoins, et les conseiller sur les meilleures pratiques en matière d’analyse bioinformatique et statistique des données.