IRD - Ingénieur en microbiologie H/F

Sous la responsabilité de directeurs de recherche IRD dans l’UMR TransVIHMI, vos activités seront les suivantes :Concevoir et organiser le traitement et l’analyse des données de séquençage : génotypage, matrice de distances, construction phylogénétique (méthodes probabilistes bayesiennes et de ressemblance, méthodes de distance …), dépôt des séquences générées sur les bases de données internationales. Élaborer et réaliser les analyses NGS.Concevoir et participer aux analyses de biologie moléculaire : amplication génomique (PCR, qPCR), préparation des librairies avant séquençage nanopore ou illumina (MiSeq ou HiSeq), séquençage (sanger, NGS).Participer aux réunions régulières du consortium organisées par l’OMSA, opérateur du projet ZOOSURSY.Élaborer et rédiger les rapports d’activités associés au projet ZOOSURSY. Animer et organiser un transfert de compétences vers les partenaires au sud de TransVIHMI dans le cadre du projet.Collaborer, avec l’assistante de l’unité et les autres collaborateurs impliqués dans le projet, au suivi budgétaire du projet ZOOSURSY et à l’élaboration des rapports financiers annuels.En cas de nécessité, s'impliquer dans les autres activités du projet ZOOSURSY se déroulant dans les cinq pays. Votre future équipeVous rejoindrez le groupe "VIH, Ebola et autres infections virales" au sein de l’équipe 1, intitulée "Diversité génétique, Résistance, Emergence, Interface homme/faune sauvage des maladies infectieuses et du VIH", basée à la Direction régionale Occitanie de l’IRD à Montpellier.Vous conduirez les activités du projet ZOOSURSY au Cameroun, la République de Guinée et la Republique Démocratique du Congo (RDC). Le projet ZOOSURSY, intitulé "Renforcement de la surveillance, de la détection précoce et de la prévention des maladies zoonotiques émergentes en Afrique", opéré par l’OMSA et financé par l’UE, a pour objectif principal de renforcer les systèmes de détection précoce et de surveillance de la faune et du bétail et de renforcer les services publics - notamment les services sanitaires et vétérinaires - impliqués dans la détection précoce afin de prévenir l'apparition de maladies zoonotiques à potentiel épidémique.